Неподалеку от ботанического сада расположен Геологический музей (Geologisk Museum), открытый в 1893 году. Здание музея, построенное в стиле итальянского Возрождения, украшено вырезанными из камня розочками, колоннами и арками.
В числе первых экспонатов музея — представленные во дворе метеориты. Самый большой из них 20-тонный метеорит был обнаружен в 1963 году в Гренландии. Данный метеорит — шестой в мире по величине.
На первом и втором этаже музея хранятся минералы и различные окаменелости. Есть здесь экспозиции, которые посвящены истории человечества, вулканам. Достойна внимания и коллекция костей динозавров.
В отдельной секции представлены экспонаты, посвященные геологии Дании. В магазине музея можно купить разноцветные камни и кристаллы.