Северная часть Бенина лежит в зоне субэкваториального климата, южная — в зоне экваториального климата.

На юге дважды в год наступает сезон дождей (в марте — июле и в конце сентября — начале ноября), количество выпавших осадков в этот период достигает 800-1300 мм. В течение месяца температура воздуха в этом районе колеблется от +24°С до +27°C. В северных регионах сменяют друг друга два сезона, сухой (апрель — май) и дождливый (июнь — ноябрь).

В январе среднемесячная температура воздуха составляет +25°C, в июле +32°C. Климат этого района более засушливый, за год выпадает порядка 750-1250 мм осадков, часто случаются засухи.