Национальный музей размещается в красивом здании, построенном в неоренессансном стиле. Он находится в конце Вацлавской площади. Здание музея, проектированием которого занимался Йозеф Шульц, является олицетворением идеи чешского национального возрождения.
В здание ведет лестница, украшенная аллегорическими скульптурами. Перед лестницей расположен фонтан с фигурами — символами чешской нации и чешской реки. На фасаде музея сохранились следы от танковых снарядов, оставшихся после обстрелов 1968 года.
Внутри здания есть монументальная лестница с бронзовыми канделябрами, которая ведет к залу Пантеона. В этом зале можно увидеть скульптуры выдающихся деятелей чешской политической, культурной и интеллектуальной жизни.
В этом же музее имеется огромное помещение, в котором представлены четыре картины Вацлава Брожика, Франтишека Женишека и Войтеха Гинайса.
Роскошный интерьер не сравнить с прекрасными экспозициями музея, посвященными минералогии, антропологии, археологии, нумизматике и естественной истории. В этом музее хранится одна из самых больших в Европе коллекций драгоценных камней.