Экваториальная Гвинея, вопреки названию, лежит не на линии экватора, а немного севернее, ближе к берегам залива Биафра (один из участков Гвинейского залива).

Выделяют материковую часть страны (Рио-Муни), прибрежную полосу, протяженностью в 130 км и шириной в 300 км, и островную часть (Биоко) — группу островов, расположенную в 40 км от берега, в заливе Биафра.

Самый крупный из островов группы — Масиас-Нгема-Бийого, а общая площадь этого участка достигает 2 тысяч км².

Рельеф континентальной части страны возвышенный, участки вулканического нагорья достигают в высоту 600-900 м (самый высокий участок — 1200 м).

У побережья тянется полоса низменностей и равнин.

В северной части Экваториальная Гвинея граничит с Камеруном, в юго-восточной — с Габоном. Площадь материковой части страны составляет 28 тысяч км².

Столица страны — Малабо, она расположена на острове Масиас-Нгема-Бийого.