Музей был открыт в 2003 году. Его экспозиция рассказывает о жизни страны в годы фашистской оккупации и в составе СССР. В число экспонатов входят документы, свидетельствующие о проведении казней и депортаций, а также пропагандистские материалы властей.
Музей создан в память о множестве жертв нацистской оккупации. Местонахождение здания — у основания холма Тоомпеа, в сердце города . Это тоже символично. Большую часть средств на создание музея выделил Кистлер-Ритс — уроженец Эстонии, перебравшийся в США в годы Второй мировой войны. Вклад Кистлер-Ритса составил 2 миллиона долларов.
