На большей части Македонии климат умеренный, характеризующийся теплым летом и прохладной зимой. Количество осадков, выпадающее в течение года, равномерное.
Температура воздуха летом составляет +21–23°C (июнь, июль), зимой — около 0°C (январь, декабрь). Годовое количество осадков в среднем составляет 500–700 мм. Наиболее влажно на юге страны.