Республика Молдова находится в юго-восточной части Европы. На севере, юге и востоке страны проходит граница с Украиной, на западе — с Румынией. Территория Молдовы составляет основную часть междуречья Прута и Днестра, включая крайнюю юго-западную его часть, а также неширокую полосу земли вдоль левого берега Днестра в среднем и нижнем течении реки.
Выхода к морю Молдавия не имеет.
Рельеф — холмистый, разделенный долинами рек. Самые высокие участки территории находятся в северной части страны (район Волынско-Подольской возвышенности), а также в центральных районах (Кодры), именно здесь расположена высшая точка Молдавии — гора Бэлэнешты (429 м).
Большая часть ландшафта — степи и возделанные земли (сады и виноградники). Все реки, протекающие по территории страны, впадают в Черное море, крупнейшие из них — Прут и Днестр.
В Молдавии есть немало озер, в основном сформировавшихся в речных долинах, в поймах рек.
75% почв — плодородный чернозем. Наиболее распространенные виды полезных ископаемых — гипс, известняк, гравий, стекольный песок, различные виды глины, а также небольшие запасы нефти и газа.